Trường hợp doanh nghiệp thanh toán hóa đơn giá trị từ 5 triệu đồng trở lên nhưng thực hiện chuyển khoản thiếu, chuyển nhầm hoặc phần còn lại thanh toán sau thì chỉ được khấu trừ thuế GTGT với phần đã thanh toán đúng quy định và có đủ chứng từ hợp lệ. Dưới đây là hướng dẫn chi tiết:
I. Điều kiện khấu trừ thuế GTGT cho hóa đơn từ 5 triệu đồng
- Hóa đơn giá trị từ 5 triệu đồng trở lên phải được thanh toán toàn bộ bằng hình thức không dùng tiền mặt (chuyển khoản, thẻ ngân hàng, ví điện tử) và có đầy đủ chứng từ hợp lệ.
- Mọi phần giá trị chưa thanh toán hoặc thanh toán sai quy cách, chưa điều chỉnh hợp lệ sẽ không đủ điều kiện khấu trừ thuế GTGT cho đến khi hoàn thiện đúng thủ tục.
II. Xử lý các trường hợp chuyển thiếu hoặc chuyển nhầm tiền
| Trường hợp | Khả năng khấu trừ | Yêu cầu bổ sung |
|---|---|---|
| Chuyển thiếu tiền | Phần đã chuyển đúng được khấu trừ | Chuyển bổ sung phần thiếu bằng chuyển khoản; lưu chứng từ cho cả hai lần chuyển |
| Chuyển nhầm số tiền | Phần chênh lệch không được khấu trừ | Điều chỉnh số tiền (hoàn trả/chuyển bổ sung); lập văn bản thỏa thuận giữa hai bên; điều chỉnh hóa đơn điện tử theo quy định tại Nghị định 70/2025/NĐ-CP |
III. Thời điểm được khấu trừ thuế
- Chỉ được khấu trừ thuế GTGT khi doanh nghiệp đã thanh toán đủ giá trị hóa đơn bằng hình thức không dùng tiền mặt và có đầy đủ chứng từ hợp lệ trong kỳ kê khai thuế tương ứng.
- Phần giá trị chưa thanh toán hoặc chưa điều chỉnh đúng quy định sẽ không được khấu trừ cho đến khi hoàn thiện bổ sung.
Ví dụ thực tế
- Hóa đơn trị giá 10 triệu đồng:
- Lần 1: Chuyển khoản 7 triệu đồng (còn thiếu 3 triệu) → chỉ được khấu trừ phần 7 triệu đồng đã chuyển đúng và có chứng từ hợp lệ.
- Lần 2: Chuyển bổ sung 3 triệu đồng còn lại → sau khi bổ sung chứng từ chuyển khoản cho phần còn thiếu, được khấu trừ 10 triệu đồng toàn bộ trên hóa đơn.
Lưu ý quan trọng
- Chứng từ thanh toán: Mỗi lần chuyển khoản phải có chứng từ hợp lệ (ủy nhiệm chi, báo nợ) ghi rõ số hóa đơn, giá trị từng lần chuyển.
- Thiếu chứng từ hợp lệ cho bất kỳ phần thanh toán nào, toàn bộ hóa đơn không được khấu trừ thuế GTGT.
- Điều chỉnh hóa đơn: Nếu chuyển nhầm, cần điều chỉnh hóa đơn điện tử, lập văn bản thỏa thuận giữa hai bên, thực hiện theo hướng dẫn tại Nghị định 70/2025/NĐ-CP. Nếu không điều chỉnh thì phần sai lệch không được khấu trừ.
- Thời hạn lưu chứng từ: Doanh nghiệp phải lưu chứng từ chuyển khoản trong kỳ kê khai thuế mà giao dịch phát sinh.
