Tổng hợp các chính sách ưu đãi thuế cho doanh nghiệp khởi nghiệp (startup) mới nhất năm 2025: ưu đãi thuế TNDN, VAT, lệ phí môn bài, thuế xuất nhập khẩu và điều kiện, thủ tục áp dụng chi tiết.

Tóm tắt các ý chính

  • Ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN): Startup được hưởng thuế suất 10% trong 15 năm, miễn thuế 4 năm và giảm 50% thuế trong 9 năm tiếp theo cho các dự án trong lĩnh vực công nghệ cao, nghiên cứu khoa học, nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao.
  • Miễn lệ phí môn bài: Doanh nghiệp khởi nghiệp được miễn lệ phí môn bài trong năm đầu thành lập, giúp giảm chi phí ban đầu.
  • Ưu đãi thuế giá trị gia tăng (VAT): Một số sản phẩm, dịch vụ công nghệ, nghiên cứu khoa học không chịu thuế GTGT; miễn thuế GTGT nhập khẩu cho máy móc, thiết bị phục vụ nghiên cứu.
  • Ưu đãi thuế xuất nhập khẩu: Miễn thuế nhập khẩu cho hàng hóa tạo tài sản cố định và nguyên liệu, vật tư trong 5 năm cho dự án đầu tư thuộc lĩnh vực ưu đãi.
  • Điều kiện hưởng ưu đãi: Doanh nghiệp phải đăng ký ngành nghề phù hợp, hoạt động trong lĩnh vực ưu đãi, thực hiện đầy đủ chế độ kế toán, hóa đơn, chứng từ và nộp thuế đúng quy định.
  • Quy trình áp dụng: Chuẩn bị hồ sơ pháp lý, kê khai thuế, nộp cho cơ quan thuế và tuân thủ giám sát để đảm bảo đủ điều kiện hưởng ưu đãi.

Đối với doanh nghiệp nhỏ và vừa khởi nghiệp sáng tạo (startup), việc tận dụng các chính sách ưu đãi thuế là “cơ hội vàng” để tối ưu hóa chi phí, giảm bớt gánh nặng tài chính và tập trung nguồn lực vào việc đổi mới, sáng tạo. Nhận thấy tầm quan trọng đó, Nhà nước đã ban hành nhiều quy định ưu đãi đặc thù nhằm thúc đẩy hệ sinh thái khởi nghiệp phát triển mạnh mẽ.

Trong bài viết này, Thuận Thiên sẽ tổng hợp và phân tích chi tiết các chính sách ưu đãi thuế cho doanh nghiệp nhỏ và vừa khởi nghiệp sáng tạo mới nhất, cùng với điều kiện, thủ tục và căn cứ pháp lý rõ ràng để bạn có thể áp dụng một cách chính xác.

Căn cứ pháp lý:

I. Đối tượng và điều kiện hưởng ưu đãi thuế

Để được hưởng các chính sách ưu đãi, doanh nghiệp nhỏ và vừa khởi nghiệp sáng tạo cần đáp ứng các điều kiện chung và riêng theo từng loại thuế. Về cơ bản, đối tượng áp dụng là:

  • Doanh nghiệp thành lập mới theo quy định của pháp luật.
  • Hoạt động trong các lĩnh vực được ưu đãi như: công nghệ cao, nghiên cứu khoa học và phát triển công nghệ, nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao, bảo vệ môi trường,…
  • Thực hiện dự án đầu tư tại các địa bàn có điều kiện kinh tế – xã hội khó khăn hoặc đặc biệt khó khăn.
  • Là doanh nghiệp nhỏ và vừa khởi nghiệp sáng tạo đáp ứng các tiêu chí theo Luật Hỗ trợ doanh nghiệp nhỏ và vừa và các văn bản hướng dẫn.

Lưu ý quan trọng: Doanh nghiệp phải đăng ký ngành nghề kinh doanh phù hợp và thực hiện chế độ kế toán, hóa đơn, chứng từ đầy đủ, đồng thời kê khai và nộp thuế theo đúng quy định.

II. Các loại thuế được ưu đãi cho doanh nghiệp nhỏ và vừa khởi nghiệp sáng tạo

Dưới đây là tổng hợp các ưu đãi thuế quan trọng mà một startup có thể được hưởng:

1. Ưu đãi thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN)

Đây là chính sách ưu đãi trọng tâm và có tác động lớn nhất đến các startup. Cụ thể:

  • Ưu đãi về thuế suất: Áp dụng mức thuế suất ưu đãi 10% trong thời gian 15 năm đối với thu nhập của doanh nghiệp từ thực hiện dự án đầu tư mới thuộc các lĩnh vực: công nghệ cao, nghiên cứu khoa học và phát triển công nghệ, sản xuất sản phẩm phần mềm, nông nghiệp ứng dụng công nghệ cao,…
  • Ưu đãi về thời gian miễn, giảm thuế: Doanh nghiệp sẽ được miễn thuế 04 năm, giảm 50% số thuế phải nộp trong 09 năm tiếp theo. Thời gian miễn, giảm thuế được tính liên tục kể từ năm đầu tiên doanh nghiệp có thu nhập chịu thuế từ dự án đầu tư mới được hưởng ưu đãi. Trường hợp không có thu nhập chịu thuế trong 3 năm đầu kể từ năm đầu tiên có doanh thu thì thời gian miễn, giảm thuế được tính từ năm thứ tư.

Lưu ý: Mức ưu đãi thuế suất 10% trong 15 năm chỉ áp dụng cho dự án đầu tư mới, thuộc lĩnh vực và địa bàn được Nhà nước ưu đãi theo quy định hiện hành, do cơ quan có thẩm quyền cấp Giấy chứng nhận đầu tư hoặc giấy xác nhận ưu đãi thuế.

2. Ưu đãi về lệ phí môn bài

  • Theo quy định tại Nghị định 139/2016/NĐ-CP (sửa đổi bởi Nghị định 22/2020/NĐ-CP), các doanh nghiệp nhỏ và vừa khởi nghiệp sáng tạo sẽ được miễn lệ phí môn bài trong năm đầu thành lập hoặc ra hoạt động sản xuất, kinh doanh (từ ngày 01/01 đến ngày 31/12). Đây là một hỗ trợ thiết thực giúp giảm chi phí ban đầu cho doanh nghiệp.
  • Nếu doanh nghiệp nhỏ và vừa chuyển đổi từ hộ kinh doanh thì còn được miễn lệ phí môn bài trong 3 năm.

3. Ưu đãi thuế giá trị gia tăng (VAT)

Một số sản phẩm, dịch vụ của doanh nghiệp nhỏ và vừa khởi nghiệp sáng tạo trong lĩnh vực công nghệ, nghiên cứu khoa học có thể thuộc đối tượng không chịu thuế GTGT hoặc được áp dụng mức thuế suất ưu đãi. Ngoài ra, doanh nghiệp được miễn thuế GTGT ở khâu nhập khẩu đối với máy móc, thiết bị, vật tư trong nước chưa sản xuất được cần nhập khẩu để phục vụ trực tiếp cho hoạt động nghiên cứu khoa học, phát triển công nghệ.

4. Ưu đãi thuế xuất khẩu, nhập khẩu

Chính sách này khuyến khích các startup đầu tư vào máy móc, công nghệ hiện đại:

  • Miễn thuế nhập khẩu đối với hàng hóa nhập khẩu để tạo tài sản cố định cho dự án đầu tư thuộc lĩnh vực ưu đãi.
  • Miễn thuế nhập khẩu trong thời hạn 05 năm kể từ ngày bắt đầu sản xuất đối với nguyên liệu, vật tư, linh kiện trong nước chưa sản xuất được để phục vụ sản xuất của dự án đầu tư thuộc lĩnh vực đặc biệt ưu đãi đầu tư.

5. Ưu đãi về tiền thuê đất, tiền sử dụng đất

Doanh nghiệp nhỏ và vừa khởi nghiệp sáng tạo thực hiện dự án đầu tư vào các lĩnh vực, địa bàn ưu đãi đầu tư có thể được xem xét miễn, giảm tiền thuê đất, tiền sử dụng đất, thuế sử dụng đất theo quy định của pháp luật về đất đai. Mức giảm có thể từ 10% – 50% hoặc miễn toàn bộ trong một khoảng thời gian nhất định.

Chính sách ưu đãi thuế cho doanh nghiệp nhỏ và vừa khởi nghiệp sáng tạo mới nhất
Chính sách ưu đãi thuế cho doanh nghiệp nhỏ và vừa khởi nghiệp sáng tạo mới nhất

III. Quy trình và thủ tục hưởng ưu đãi thuế

Để được áp dụng các chính sách ưu đãi, doanh nghiệp không được tự ý áp dụng mà phải thực hiện các thủ tục cần thiết. Thuận Thiên và bạn hãy cùng xem qua quy trình cơ bản:

  • Bước 1: Chuẩn bị hồ sơ: Doanh nghiệp cần chuẩn bị bộ hồ sơ pháp lý đầy đủ, bao gồm Giấy chứng nhận đăng ký doanh nghiệp, hồ sơ dự án đầu tư, các giấy tờ chứng minh đủ điều kiện hưởng ưu đãi (ví dụ: Giấy chứng nhận doanh nghiệp khoa học và công nghệ, quyết định chủ trương đầu tư,…).
  • Bước 2: Kê khai và nộp hồ sơ: Doanh nghiệp tự xác định các điều kiện ưu đãi, mức ưu đãi và kê khai trong hồ sơ khai thuế TNDN, lệ phí môn bài… nộp cho cơ quan thuế quản lý trực tiếp.
  • Bước 3: Thẩm định và giám sát: Cơ quan thuế sẽ tiếp nhận hồ sơ và tiến hành kiểm tra, đối chiếu. Nếu doanh nghiệp đáp ứng đủ điều kiện, cơ quan thuế sẽ chấp thuận cho hưởng ưu đãi. Trong quá trình hoạt động, cơ quan thuế sẽ thực hiện giám sát việc tuân thủ các điều kiện ưu đãi của doanh nghiệp.
  • Bước 4: Báo cáo và theo dõi: Doanh nghiệp có trách nhiệm báo cáo tình hình hoạt động và việc duy trì các điều kiện hưởng ưu đãi theo yêu cầu của cơ quan chức năng.

IV. Tóm tắt Chính sách ưu đãi thuế cho doanh nghiệp nhỏ và vừa khởi nghiệp sáng tạo mới nhất

Việc nắm vững và áp dụng thành công các chính sách ưu đãi thuế là một lợi thế cạnh tranh rất lớn cho các doanh nghiệp nhỏ và vừa khởi nghiệp sáng tạo tại Việt Nam. Các chính sách này không chỉ giúp giảm áp lực tài chính mà còn tạo điều kiện để startup tái đầu tư, mở rộng quy mô và phát triển bền vững.

Hy vọng rằng, những thông tin mà Thuận Thiên cung cấp sẽ giúp bạn có cái nhìn toàn diện và áp dụng hiệu quả các quy định pháp luật để tối đa hóa lợi ích cho doanh nghiệp của mình.

Câu Hỏi Thường Gặp

Không. Các chính sách ưu đãi thuế thường tập trung vào các lĩnh vực được nhà nước khuyến khích như công nghệ cao, nghiên cứu và phát triển, nông nghiệp công nghệ cao, bảo vệ môi trường. Doanh nghiệp hoạt động thương mại, dịch vụ thông thường sẽ không thuộc đối tượng được hưởng các ưu đãi đặc thù này, trừ khi đặt tại địa bàn có điều kiện kinh tế – xã hội khó khăn hoặc đặc biệt khó khăn.

Nếu doanh nghiệp thay đổi ngành nghề kinh doanh, ưu đãi thuế sẽ được xem xét lại. Trường hợp ngành nghề mới vẫn thuộc danh mục được ưu đãi, doanh nghiệp có thể tiếp tục được hưởng. Tuy nhiên, nếu ngành nghề mới không thuộc diện ưu đãi, doanh nghiệp sẽ phải chuyển sang áp dụng mức thuế suất thông thường kể từ thời điểm thay đổi và có thể bị truy thu phần thuế đã được hưởng ưu đãi không đúng quy định.

Không phải tất cả các ưu đãi đều yêu cầu giấy chứng nhận này. Nhiều ưu đãi thuế được áp dụng dựa trên lĩnh vực, ngành nghề hoặc địa bàn đầu tư mà doanh nghiệp đăng ký. Tuy nhiên, để được hưởng các chính sách hỗ trợ đặc thù theo Luật Hỗ trợ DNNVV dành riêng cho ‘doanh nghiệp nhỏ và vừa khởi nghiệp sáng tạo’, doanh nghiệp cần được lựa chọn hoặc chứng nhận bởi một cơ quan có thẩm quyền theo quy định tại Nghị định 80/2021/NĐ-CP.

Có. Doanh nghiệp hoàn toàn có thể vừa hưởng ưu đãi về thuế, vừa tiếp cận các nguồn vốn vay ưu đãi, các quỹ hỗ trợ khởi nghiệp, quỹ phát triển khoa học công nghệ của Nhà nước. Đây là các chính sách hỗ trợ song song nhằm tạo điều kiện phát triển tốt nhất cho startup, miễn là doanh nghiệp đáp ứng đủ điều kiện của từng chương trình và đảm bảo minh bạch trong việc sử dụng các nguồn lực.

Thời gian miễn, giảm thuế được tính liên tục từ năm đầu tiên doanh nghiệp có thu nhập chịu thuế. Trong trường hợp doanh nghiệp không có thu nhập chịu thuế trong 3 năm đầu, kể từ năm đầu tiên có doanh thu từ dự án, thì thời gian miễn, giảm thuế sẽ được tính bắt đầu từ năm thứ tư. Điều này đảm bảo doanh nghiệp được hưởng trọn vẹn quyền lợi ưu đãi khi bắt đầu có lợi nhuận.