Nếu phát hiện sai lệch thuế GTGT (VAT) sau khi ký kết hợp đồng, doanh nghiệp cần thực hiện điều chỉnh theo đúng quy định pháp luật để đảm bảo tính minh bạch và tuân thủ nghĩa vụ thuế. Dưới đây là quy trình thực hiện chi tiết và lưu ý quan trọng.
I. Quy trình điều chỉnh giá trị hợp đồng khi phát hiện sai lệch thuế GTGT sau ký kết
1. Thỏa thuận và lập văn bản điều chỉnh
- Hợp đồng trọn gói/dài hạn: Lập phụ lục hợp đồng ghi rõ nội dung điều chỉnh (thuế suất/giá trị), phạm vi áp dụng (chỉ phần công việc bị ảnh hưởng trực tiếp), có chữ ký xác nhận của hai bên.
- Giao dịch ngắn hạn: Lập văn bản thỏa thuận riêng, bắt buộc với doanh nghiệp/tổ chức từ 01/06/2025.
2. Xuất hóa đơn điều chỉnh
- Ghi rõ: “Điều chỉnh cho hóa đơn số… ngày…” và thể hiện chênh lệch giá trị (ghi số âm nếu làm giảm giá trị).
- Không tích chọn “Tự động tính toán” trên hóa đơn điện tử.
- Với điều chỉnh toàn bộ: Ghi chú tại cột “Tính chất HHDV”.
3. Kê khai thuế bổ sung
- Bên bán: Kê khai điều chỉnh thuế đầu ra tại kỳ phát sinh hóa đơn điều chỉnh.
- Bên mua: Điều chỉnh thuế đầu vào (nếu đủ điều kiện) khi nhận hóa đơn điều chỉnh.
- Xử lý nộp thừa: Bù trừ vào kỳ thuế sau.
Ví dụ thực tế
Hợp đồng xây dựng trị giá 2 tỷ đồng (đã bao gồm 10% thuế GTGT). Phát hiện áp dụng sai thuế suất (phải là 8% theo Nghị định 44/2023/NĐ-CP):
- Lập phụ lục hợp đồng điều chỉnh thuế suất từ 10% → 8%.
- Xuất hóa đơn điều chỉnh giảm:
| Mặt hàng | Đơn giá điều chỉnh | Thuế GTGT | Tổng tiền |
|---|---|---|---|
| Xây dựng nhà A | -40.000.000 VNĐ | -3.200.000 VNĐ | -43.200.000 VNĐ |
- Kê khai giảm thuế đầu ra (bên bán) và điều chỉnh thuế đầu vào (bên mua).
Lưu ý quan trọng
- Hiệu lực pháp lý: Phụ lục hợp đồng có giá trị đến hết ngày 31/12/2025 và là bộ phận không thể tách rời hợp đồng gốc.
- Thời điểm điều chỉnh: Thực hiện ngay khi phát hiện sai sót, chậm nhất là ngày làm việc tiếp theo sau khi lập hóa đơn.
- Phạm vi điều chỉnh: Chỉ áp dụng cho phần giá trị/công việc bị ảnh hưởng trực tiếp bởi thay đổi chính sách thuế.
- Hợp đồng đặc thù: (xây dựng, dịch vụ dài hạn): Sử dụng bảng kê kèm hóa đơn nếu được Bộ Tài chính cho phép.
